Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04436 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04436 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04436 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms