Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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