Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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