Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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