Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL21O00585 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL21O00585 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL21O00585 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL21O00585 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL21O00585 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL21O00585 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL21O00585 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL21O00585 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL21O00585 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL21O00585 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL21O00585 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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