Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms