Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms