Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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