Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms