Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms