Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms