Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms