Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms