Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms