Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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