Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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