Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms