Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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