Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NRIP3Q9NQ35 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms