Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms