Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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