Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms