Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms