Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms