Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLF1Q9BQI6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms