Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms