Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms