Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG2BQ96BY7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG2BQ96BY7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms