Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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GTF3C6Q969F1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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