Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAPGEF4Q8WZA2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF4Q8WZA2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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