Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX18Q8N8Q8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX18Q8N8Q8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms