Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP13Q86W25 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms