Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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