Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms