Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms