Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms