Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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