Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms