Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP170Q5SW79 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms