Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC93Q567U6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms