Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms