Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms