Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms