Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms