Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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