Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms