Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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