Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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