Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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UBE3CQ15386 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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UBE3CQ15386 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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UBE3CQ15386 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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UBE3CQ15386 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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UBE3CQ15386 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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UBE3CQ15386 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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