Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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